智慧团建认证不通过是没有影响的。只要是经过入团程序发展入团的，不会影响，因为有团员档案。

“网上共青团”是共青团中央主办的互联网工程，是一种“互联网+共青团”的新模式。“网上共青团”建设以“智慧团建”和“青年之声”为重点，建设工作网、联系网、服务网“三网合一”的“网上共青团”，形成“互联网+共青团”格局，实现团网深度融合、团青充分互动、线上线下一体运行。